腫瘤診斷 這個(gè)方法或比基因檢測更“靈光”
2019-03-07 07:27:34 來源: 科技日報(bào)
關(guān)注新華網(wǎng)
微博
Qzone
評論
圖集

視覺中國

  “即便《我不是藥神》中那款所謂‘靶向神藥’的原型格列衛(wèi),患者使用5年后也會出現(xiàn)耐藥現(xiàn)象?!敝袊こ淘涸菏?、腫瘤病因?qū)W家程書鈞說,若干年來,人們希望以基因?yàn)榫€索“鉗制”腫瘤,似乎難以長效?!翱吹骄薮蟮倪M(jìn)步,以為腫瘤要攻破了,幾年后卻會發(fā)現(xiàn)這個(gè)方法有限?!?/p>

  追蹤基因到底能不能接近到腫瘤發(fā)生的“真相”?用基因檢測、靶向治療的方法,究竟有沒有可能在未來“治本”?如果追蹤基因繞了遠(yuǎn)路,那么有沒有什么捷徑呢?

  近日,香山會議召開第645次學(xué)術(shù)會議,議題為“后基因組時(shí)代與腫瘤轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”。研討腫瘤多學(xué)科治療的新技術(shù)和可能的未來。

  基因突變不一定“癌變”

  “癌變”細(xì)胞會發(fā)生基因突變,但有基因突變的細(xì)胞,并不一定發(fā)生癌變。

  為了弄清楚什么導(dǎo)致了“癌變”,必須先摸清腫瘤細(xì)胞的基因組有什么特點(diǎn),美國重大科研項(xiàng)目“癌癥基因組圖集”(The Cancer Genome Atlas,TCGA)2006年啟動,預(yù)計(jì)耗資1億美元,但幾經(jīng)追資,經(jīng)費(fèi)支出遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出預(yù)算。對33種共1萬例人腫瘤樣本進(jìn)行基因測序分析,最終來自16個(gè)國家的科學(xué)家們相互協(xié)作發(fā)現(xiàn)了近1000萬個(gè)癌癥相關(guān)突變。

  “他們最終確定發(fā)現(xiàn)了299個(gè)癌癥驅(qū)動基因?!背虝x說,但是臨床上,人們卻發(fā)現(xiàn)了“捉摸不定”的問題,同一類型腫瘤的不同人,基因突變差異很大;甚至同一患者的同一腫瘤內(nèi)部的不同細(xì)胞之間,基因突變也有差異。

  如果癌癥驅(qū)動基因是“癌變”與否的決定性因素,又怎么能存在殊途同歸呢?腫瘤基因突變學(xué)說遭遇挑戰(zhàn)。

  靶向抗癌藥格列衛(wèi)正是由于對抗染色體DNA易位所造成的細(xì)胞的“異變”才奏效,但對它的抗藥性的產(chǎn)生,說明會出現(xiàn)新的變異細(xì)胞,想辦法“逃”出了格列衛(wèi)阻控的通道。

  “如果從根源上全面認(rèn)識腫瘤的發(fā)生發(fā)展和演進(jìn)轉(zhuǎn)歸,難以在時(shí)間和空間上鎖定治愈腫瘤的關(guān)鍵?!背虝x說。

  “目前有近百個(gè)分子靶向藥物是基于基因相關(guān)的細(xì)胞癌變機(jī)制研發(fā)出來,已廣泛應(yīng)用于腫瘤的臨床治療?!北本┐髮W(xué)腫瘤醫(yī)院、北京市腫瘤防治研究所分子腫瘤學(xué)研究室呂有勇教授說,但這些研究結(jié)論是建立在有限的基因分析基礎(chǔ)上。

  蛋白質(zhì)檢測更有優(yōu)勢

  如果說基因是一把“鑰匙”,蛋白質(zhì)更像一把“鎖”——基因需要通過蛋白質(zhì)的作用,才能打開“門”看個(gè)究竟。然而,問題是,蛋白質(zhì)這把“鎖”,有很多把“鑰匙”能夠打開。

  那么,研究可不可以從更直接的“鎖”入手?

  “蛋白質(zhì)更加下游,離結(jié)果更近?!眹业鞍踪|(zhì)科學(xué)中心教授秦鈞說,作為生命的直接執(zhí)行者,蛋白質(zhì)和基因相比在醫(yī)學(xué)上應(yīng)有更大的優(yōu)勢。

  蛋白質(zhì)組學(xué)的概念1994年誕生,但是名氣和普及度不如基因組學(xué)。

  “在檢測技術(shù)上,蛋白質(zhì)存在很大的難度?!鼻剽x分析其中的原因,由于蛋白質(zhì)不像DNA可以擴(kuò)增,其大規(guī)模檢測一直充滿挑戰(zhàn)。

  高通量DNA測序儀的發(fā)明使得對單個(gè)基因組的檢測從13年變成了現(xiàn)在的不到半小時(shí),速度的指數(shù)倍提升成就了今天基因測序技術(shù)的大規(guī)??茖W(xué)研究、臨床使用。和基因檢測類似,更高效的色譜—質(zhì)譜儀的應(yīng)用和蛋白組樣本制備的完善,從2013年開始,讓人們獲得了檢測蛋白組的手段和工具。

  “對于生物樣本的蛋白檢測,需要一下子檢測1萬多個(gè)蛋白質(zhì)?!鼻剽x說,而實(shí)現(xiàn)短時(shí)間內(nèi)檢測大量的樣本,才能夠使蛋白質(zhì)組技術(shù)真正得到應(yīng)用。

  高通量、大規(guī)模、準(zhǔn)確性,是檢測技術(shù)能夠落地臨床應(yīng)用的必備“三寶”?!敖裉?,蛋白質(zhì)組學(xué)可以實(shí)現(xiàn)對各類生物樣本的高通量、大規(guī)模的準(zhǔn)確檢測,可以描繪出萬種蛋白質(zhì)的精細(xì)變化,包括表達(dá)、修飾、定位、相互作用的高維度圖譜?!鼻剽x說。

  有了檢測數(shù)據(jù)之后,如何集納分析,獲取有效信息呢?“我們配備了天河二號計(jì)算機(jī),用于生物信息的大數(shù)據(jù)分析?!鼻剽x說。

  至此,蛋白質(zhì)檢測成為繼基因測序之后,可能揭示腫瘤細(xì)胞發(fā)生機(jī)制的另一個(gè)路徑。中國人類蛋白組計(jì)劃也于2014年啟動,花了大量的時(shí)間做應(yīng)用前的摸索工作。

  “我們已經(jīng)擁有了十大惡性腫瘤蛋白組變化的地形圖,掌握了腫瘤信號通路和潛在治療靶點(diǎn)等第一手準(zhǔn)確信息?!鼻剽x說,基因組在出生篩查、疾病風(fēng)險(xiǎn)等“先天”決定因素的判斷方面取得了成功,蛋白質(zhì)組會在判斷“后天”因素蛋白組學(xué)驅(qū)動的精準(zhǔn)醫(yī)療成為可能。

  腫瘤的“隱秘”可被刺探

  “我們發(fā)現(xiàn)腫瘤病灶本身有些變異的基因不再編碼‘有用’蛋白,仿佛被‘遺棄’了。”秦鈞說,用蛋白質(zhì)層面的檢測方法他們發(fā)現(xiàn)了腫瘤患者身體里此前從未觀察到的現(xiàn)象。

  人們一直認(rèn)為,腫瘤原發(fā)灶是“萬惡之源”,多種治療方法均以原發(fā)灶為“靶子”,很可能并沒瞄準(zhǔn)“重點(diǎn)”?!坝袝r(shí)候,癌旁組織中的‘有用’蛋白,反而異常活躍了?!鼻剽x說,真正要打擊的可能應(yīng)該是“前鋒”,它們正在患者體內(nèi)“攻城略地”?!暗@些目前還僅僅是猜測,需要進(jìn)行更深入的機(jī)理研究,才能有所明確?!?/p>

  “我們還發(fā)現(xiàn),可以通過蛋白分子分型,精準(zhǔn)預(yù)測病人的預(yù)后情況?!鼻剽x說,畫出健康組織的像和腫瘤組織的像,通過比較找到不同類型腫瘤的區(qū)別,然后依據(jù)治療情況,找出對應(yīng)關(guān)系。

  從2012年開始,秦鈞團(tuán)隊(duì)聯(lián)合北京腫瘤醫(yī)院沈琳團(tuán)隊(duì)開始大規(guī)模胃癌樣品分析,給彌漫型胃癌“畫像”。他們從2451例胃癌樣品中篩選出滿足研究要求的83例癌和配對的癌旁組織樣本,將彌漫型胃癌分為3個(gè)與生存、預(yù)后和化療敏感性密切相關(guān)的分子亞型。

  三種“畫像”的彌漫型胃癌患者,就像三種不同的“人格”,在術(shù)后化療效果和生存時(shí)間長短上有明顯差異?!斑@項(xiàng)研究通過蛋白質(zhì)組的高精度分辨,發(fā)現(xiàn)了與預(yù)后相關(guān)的分子分型。下一步針對不同類型的彌漫型胃癌,或者其他類型的腫瘤,我們就可以嘗試做精準(zhǔn)的診斷和治療?!鼻剽x說。

  “蛋白質(zhì)組技術(shù)近年取得了突破性進(jìn)展?!鼻剽x表示,現(xiàn)在通常在6小時(shí)內(nèi)就可以定量到8000個(gè)以上的蛋白質(zhì)產(chǎn)物,與細(xì)胞內(nèi)實(shí)際表達(dá)的蛋白種類相當(dāng),而檢測精度也大幅提升,樣本數(shù)量可以低至含10000個(gè)細(xì)胞、大約幾個(gè)立方毫米的組織即可。已經(jīng)能夠達(dá)到臨床要求。

  未來,在建立以醫(yī)院、蛋白質(zhì)檢測機(jī)構(gòu)、大數(shù)據(jù)分析機(jī)構(gòu)為組成部分的聯(lián)合體的基礎(chǔ)上,可以實(shí)現(xiàn)基礎(chǔ)研究,臨床前研究和臨床轉(zhuǎn)化的無縫連接。

  用蛋白質(zhì)作為“刺探”腫瘤“大本營”的工具會不會事半功倍,還有待時(shí)間的檢驗(yàn)。目前,“中國人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃”選擇了肝癌、胃癌、肺腺癌等十余種腫瘤作為研究對象,檢測數(shù)據(jù)采集已基本完成,陸續(xù)進(jìn)入數(shù)據(jù)分析和成果產(chǎn)出階段。肝癌、胃癌已經(jīng)取得階段性成果,未來,蛋白質(zhì)組可以像基因組一樣用于臨床治療的判斷依據(jù),或許為個(gè)體化治療、精確性治療、靶向治療等新的治療手段,提供更有效的治療策略和治療思路。(記者 張佳星)

+1
【糾錯(cuò)】 責(zé)任編輯: 韓家慧
新聞評論
加載更多
巴西圣保羅的街頭狂歡
巴西圣保羅的街頭狂歡
考察成果豐碩 “雪龍”號穿越赤道返回北半球
考察成果豐碩 “雪龍”號穿越赤道返回北半球
黃河壺口瀑布水量增大
黃河壺口瀑布水量增大
雪霽塔云仙境
雪霽塔云仙境

?
010020020110000000000000011198061124201915